Responsable: Laurent Gentzbittel
- 74 heures en présentiel
Intervenants:
Cécile Ben
Mondher Bouzayen
Gérard Bozzolo
Laurent Gentzbittel
Jean Kallerhoff
Farid Regad
Martina Rickauer
Zulma Vitezica
Mohamed Zouine
FINALITES
Les applications technologiques de la génétique sont présentes au quotidien, que ce soit dans la production de matières premières, l'amélioration des espèces agronomiques animales ou végétales, l’élaboration et la fabrication de produits alimentaires ou la santé humaine.
L’ingénieur agronome doit donc posséder un niveau de compréhension approfondie des concepts et des méthodes utilisées en génétique.
OBJECTIFS
Les notions développées couvrent les grands domaines classiques : microbiologie, sciences animales et végétales. Les avancées technologiques les plus récentes seront mises en perspective.
Les objectifs assignés concernent :
- La compréhension des mécanismes de recombinaison génétique et de mutagenèse
- La connaissance des apports récents en génétique évolutive et quantitative
- La compréhension des méthodes d’analyse en génétique eucaryote et procaryote
- La mise en perspective des méthodes d’amélioration génétique du bétail et la nécessaire organisation institutionnelle
- La sensibilisation à l’érosion du patrimoine biologique et à la mise en place des actions conservatoires
PLACE DANS LA FORMATION
Cet enseignement de génétique générale est dispensé avant les modules de pré-spécialisation de S4, dans lesquels une formation spécialisée en génétique est dispensée.
ORGANISATION GENERALE
24 séances de cours magistraux, 16 séances de TD-TP de 2h ou 3h
EVALUATION
Examen écrit pour chaque module
Modalités de rattrapage
Examen écrit ou oral pou chaque module
PROGRAMME
Module 1 : Génétique Générale et Microbienne – 11 séances de cours, 5 séances de TD
Génétique microbienne :
Organisation du matériel génétique
- Génomique comparative des procaryotes (organisation des chromosomes, transfert génétique horizontal, ilôts de pathogénicité, organisation des gènes impliqués dans la symbiose)
- Organisation en structures opéronales
Régulation de l'expression des gènes procaryotes
- les différents niveaux et modes de régulation
- régulateurs transcriptionnels (contrôle positif et négatif, mécanisme d'atténuation, notion de contrôle global, etc)
- mécanismes de transduction de signal (systèmes à deux composants, régulation en cascade)
Génétique Générale :
- Génétique formelle et Analyses d'épistasie
- Génétique évolutive : Evolution des gènes et des génomes eucaryotes, macro et micro-synténie. Exemples dans les règnes animaux et végétaux.
- Génétique quantitative : Notion de réponse différentielle à l’environnement. Un seul locus peut contribuer à la variation. La variation génétique pour des caractères gouvernés par plusieurs locus.
Module 2 : Génétique Moléculaire – 6 séances de cours, 6 séances de TD
- Marqueurs génétiques
- Stratégies de mutagenèse : génétique foward, genetique reverse
- Programmes de séquençages génomiques
- Les techniques principales de l'analyse moléculaire : la PCR ses dérivés et applications, méthodes de séquençage.
Module 3 : Génétique pour l'Amélioration des Plantes – 2 séances de cours , 3 séances de TD de 2h, 2 TD de 3h.
Génétique végétale :
Ce module donne un premier aperçu des différentes techniques couramment utilisées en amélioration des plantes. Les notions importantes pour la sélection des caractères quantitatifs sont abordées.
- 1 cours magistral : présentation des différentes ressources et méthodes utilisées en amélioration et sélection des plantes.
- 1 TD (3h) : Déterminisme génétique des caractères quantitatifs
- 1 TD (3h) : Hétérosis
Evaluation : Notation de l'un des 2 TD (choisi au hasard). Examen final écrit
Biotechnologie végétale :
Ce module donne un premier aperçu des biotechnologies végétales, et de leur apport pour l’amélioration des plantes
- 1 cours magistral : présentation des enjeux socio-économiques et des méthodologies utilisés en Biotechnologies végétales – culture in vitro et génie génétique.
- 1 TD (2h) : approfondissement sur les méthodes de civ et préparation du TP
- 1 TP (2h) : culture in vitro – régénération de Saintpaulia par organogenèse directe et démonstration de l’influence des phytohormones
- 1 TD (2h) : analyse des résultats du TP et approfondissement des principes de transgenèse
Evaluation : un examen final écrit
Module 4 : Génétique pour l'Amélioration des Animaux- 5 séances de cours
Module construit pour faire la synthèse sur les méthodes d’amélioration des espèces animales domestiques agrégeant et combinant les différentes retombées de la génétique mendélienne, des populations, quantitative, SAM, ainsi que l’organisation nationale découlant de la LOA 2006.
Il réserve aussi un mini espace résiduel à la situation des races à faibles effectifs, marqueurs territoriaux et patrimoniaux intégrées dans une mouvance conservatoire au titre de la lutte contre l’érosion de la biodiversité.
Evaluation : QCM final